В Нагорном Карабахе функционирует 8 вузов, в том чиисле, Арцахский государственный университет, а также филиалы ряда ереванских и московских вузов. В общей сложности в АрГУ и негосударственных вузах обучаются более 4500 студентов, а число студентов, получающих второе высшее образование, составляет примерно 200 человек. По официальным данным, более 90% выпускников карабахских школ поступают в вузы. Только в 2006 году в Степанакерте было восстановлено профтехучилище.

По словам заведующего отделом образования Министерства образования, культуры и спорта Нагорного Карабаха Соса Арзуманяна, университеты "Григор Нарекаци", "Месроп Маштоц", а также Степанакертский филиал Ереванского института прикладных искусств имени Гюрджяна, получили государственную аккредитацию. Процесс аккредитации может длиться несколько лет и включает в себя систему проверок на предмет соответствия разного рода параметрам.